少年三国志2在游戏人物立绘方面要比1丰富很多，游戏邀请了知名的画师进行2代的立绘创作，同时还将spine动画技术融入游戏中，可以让武将的动作看起来更加逼真一些，整体画质更具质感与立体度。游戏也从1代的竖版变为了横版，UI界面更为精致，游戏的完成度与视觉表现力有了显著的提升。
两代游戏存在明显差异。相比较于1代略显枯燥的阵容搭配，少年三国志2加入了新的兵符系统，玩家能够上阵更多武将同时带来精彩的合击技能，这使得战斗的策略性和多样性得到了极大的拓展，不再是简单的武将上阵触发合击。兵符系统的引入让布阵更有讲究，策略深度拉满，玩家可以组合出如群体爆发、眩晕控场等百种战术。
少年三国志2在1的基础上融入了名将传等新玩法，玩家可以通过名将传，体验不同的三国名将的人生和故事，同时还可以进行自由探索引发各种奇遇。这相当于在传统的卡牌养成与战斗之外，增加了角色扮演和探索的元素，让玩家能更沉浸地体验三国世界。
2代在继承1代武将养成、道具装备及阵容搭配克制等核心玩法的基础上，对游戏的各个方面进行了优化与创新。游戏的氪金元素有所调整，虽然核心养成框架相似，但推出活动的频率更高，玩家通过投入时间可以获取的福利也相对更多。游戏的质量与内容量都有所提升，战斗体验因为兵符等系统的加入而变得更加有趣。
玩家在少年三国志2中扮演一名时空局实习生的角色，因三国时代混乱而穿越，这为游戏剧情提供了一个全新的切入视角。游戏在细节上，如装备系统、主角的时装与神翼系统等方面也进行了更深入的拓展与细化。这些变化共同构成了2代区别于1代的独特体验。
